הלימודים לקראת התואר השני מכוונים להקנות לתלמידים השכלה רחבה ומעמיקה במחשבה היהודית לתקופותיה ולפתוח בפניהם גישה אל דרכי המחקר בנושאי התמחות מתוך ארבעת מדורי החוג (המחשבה היהודית בתקופת המשנה והתלמוד; הפילוסופיה היהודית בימי הביניים; קבלה וחסידות; המחשבה היהודית בעת החדשה) לפי בחירת התלמיד.
הלימודים לקראת התואר השני מכוונים להקנות לתלמידים השכלה רחבה ומעמיקה במחשבה היהודית לתקופותיה ולפתוח בפניהם גישה אל דרכי המחקר בנושאי התמחות מתוך ארבעת מדורי החוג (המחשבה היהודית בתקופת המשנה והתלמוד; הפילוסופיה היהודית בימי הביניים; קבלה וחסידות; המחשבה היהודית בעת החדשה) לפי בחירת התלמיד.