מטרות הלימודים לתואר השני הן להעמיק את ידיעותיהם והבנתם של התלמידים בתחומים השונים של הסוציולוגיה והאנתרופולוגיה, לקדם את ההתפתחותם התיאורטית והמתודולוגית, ולכוון אותם למגמות לימוד ותחומי התמחות על פי כישוריהם ונטיותיהם. בתחום ההתמחות יכולים התלמידים להכשיר את עצמם הן כחוקרים והן כאנשי מקצוע בתחומים..
מטרות הלימודים לתואר השני הן להעמיק את ידיעותיהם והבנתם של התלמידים בתחומים השונים של הסוציולוגיה והאנתרופולוגיה, לקדם את ההתפתחותם התיאורטית והמתודולוגית, ולכוון אותם למגמות לימוד ותחומי התמחות על פי כישוריהם ונטיותיהם. בתחום ההתמחות יכולים התלמידים להכשיר את עצמם הן כחוקרים והן כאנשי מקצוע בתחומים השונים של הדיסציפלינה כגון סוציולוגיה של ארגונים, פסיכולוגיה חברתית, סוציולוגיה של הבריאות, חברה ותרבות ואנתרופולוגיה חברתית. במסגרת הלימודים לקראת התואר השני באים התלמידים במגע אישי והדוק עם מורי המחלקה ונחשפים לתחומי התמחותם ומחקריהם באופן המכין ומכוון אותם למחקר וכתיבה של עבודות הגמר שלהם.